Тіло розділене на голову, тулуб і кінцівки (п'ятипалі, важільного типу), покрито голою, слизової шкірою.
У хребті виділяють 4 відділи: шийний, тулубовий, крижовий і хвостовий. Число хребців — від 7 у безхвостих до 200 у безногих земноводних.
Тіло земноводних сплюснене в спинно-черевному напрямку, має двобічну симетрію. Є дві пари кінцівок, що закінчуються пальцями.
Шийний відділ хребта у всіх земноводних містить тільки один хребець, який рухомо приєднується до потиличного відділу черепа (забезпечує рухливість голови), завдяки чому земноводні можуть опускати і піднімати голову. Число тулубових хребців є різною (від 7 у жаби до 100 і більше у представників ряду Безногих).
Амфібії — холоднокровні тварини, вони не підтримують постійну температуру тіла. Серце у дорослих тварин — трикамерне, у личинок (у жаби — пуголовок) — двокамерне. Венозна кров від органів і тканин збирається у вени і надходить у праве передсердя, а потім — у шлуночок.
У земноводних з'явився друге — легеневе коло кровообігу і трикамерне серце, яке складається з двох передсердь і одного шлуночка, в якому міститься частково змішана кров.
Вага головного мозку у відсотках від маси тіла становить у сучасних хрящових риб 0,06-0,44 %, у кісткових риб 0,02-0,94 %, у хвостатих земноводних 0,29-0,36 %, у безхвостих 0,50-0,73 %.